24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3570 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3570  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIBC subunit  100 
 
 		 326 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.944812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3142  PTS system glucitol/sorbitol-specific transporter subunit IIB  82.92 
 
 		 323 aa  537  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2953  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  82.92 
 
 		 323 aa  537  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2984  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  82.92 
 
 		 323 aa  537  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3019  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  82.92 
 
 		 323 aa  537  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.824211  hitchhiker  0.00000475324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3035  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  82.92 
 
 		 323 aa  537  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  hitchhiker  0.00564153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2826  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIB component  82.61 
 
 		 319 aa  534  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.204454  hitchhiker  0.0000775819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02518  hypothetical protein  82.61 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.660273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3174  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIB component  82.61 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1009  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIBC subunit  81.99 
 
 		 319 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000525886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2987  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIB component  82.61 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2839  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIB component  81.99 
 
 		 319 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02553  glucitol/sorbitol-specific enzyme IIB component of PTS  82.61 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0986  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIBC subunit  82.61 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.337304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0678  PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIBC component  78.83 
 
 		 331 aa  529  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000916157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1064  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIBC subunit  59.1 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3331  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  48.46 
 
 		 330 aa  315  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.624452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3775  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  51.04 
 
 		 336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179423  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4110  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  52.96 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.603955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2220  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  50.17 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.447451 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2926  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  45.57 
 
 		 326 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  hitchhiker  0.0000393385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  66.37 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  63.72 
 
 		 572 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  63.72 
 
 		 572 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>