12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3028 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3028  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514475  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4319  hypothetical protein  38.73 
 
 
174 aa  97.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2138  hypothetical protein  31.52 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.309943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4911  hypothetical protein  38.16 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92609  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6003  hypothetical protein  31.71 
 
 
173 aa  87.8  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110653  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4195  hypothetical protein  33.15 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225203  normal  0.0111128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2157  hypothetical protein  29.21 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5771  hypothetical protein  28.12 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0108  hypothetical protein  27.54 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2020  hypothetical protein  27.61 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0565565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4765  hypothetical protein  23.87 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000253254  hitchhiker  0.000175617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1391  hypothetical protein  28.77 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>