15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0108 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0108  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  340  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1391  hypothetical protein  60.24 
 
 
167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4319  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2138  hypothetical protein  44.24 
 
 
182 aa  131  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.309943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4195  hypothetical protein  43.64 
 
 
181 aa  130  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225203  normal  0.0111128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2157  hypothetical protein  35.93 
 
 
191 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6003  hypothetical protein  35.58 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110653  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5771  hypothetical protein  30.3 
 
 
171 aa  94  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4911  hypothetical protein  34.64 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92609  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4791  hypothetical protein  33.53 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.524099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3028  hypothetical protein  27.54 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514475  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6045  hypothetical protein  28.3 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2020  hypothetical protein  25.15 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0565565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4765  hypothetical protein  31.17 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000253254  hitchhiker  0.000175617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0876  hypothetical protein  34.25 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421215  normal  0.502817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>