26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5149 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5149  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  243  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0684  hypothetical protein  84.48 
 
 		 116 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0648  hypothetical protein  71.3 
 
 		 122 aa  175  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236963  normal  0.0853662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0936  hypothetical protein  71.55 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12913  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0118  hypothetical protein  68.1 
 
 		 117 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0219107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3700  hypothetical protein  63.79 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.27307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3070  hypothetical protein  66.67 
 
 		 113 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2891  hypothetical protein  59.48 
 
 		 116 aa  153  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2449  hypothetical protein  61.61 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000555956  normal  0.0107248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01710  hypothetical protein  59.13 
 
 		 117 aa  151  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  0.513995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1004  hypothetical protein  58.62 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3395  hypothetical protein  60.71 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3198  hypothetical protein  59.82 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2452  hypothetical protein  58.93 
 
 		 114 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132241  hitchhiker  0.00000023892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3293  hypothetical protein  59.82 
 
 		 139 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4461  hypothetical protein  59.46 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3322  hypothetical protein  60.71 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3243  hypothetical protein  61.11 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02580  hypothetical protein  55.36 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0463  hypothetical protein  51.3 
 
 		 115 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0495  hypothetical protein  52.17 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2830  hypothetical protein  51.33 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00362163  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2319  hypothetical protein  51.79 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6024  hypothetical protein  51.35 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1511  hypothetical protein  49.55 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.337807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06290  hypothetical protein  37.17 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>