26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3070 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3070  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2452  hypothetical protein  73.87 
 
 
114 aa  178  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132241  hitchhiker  0.00000023892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02580  hypothetical protein  72.32 
 
 
113 aa  175  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2449  hypothetical protein  70.54 
 
 
122 aa  170  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000555956  normal  0.0107248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4461  hypothetical protein  74.34 
 
 
113 aa  167  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1004  hypothetical protein  65.18 
 
 
118 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5149  hypothetical protein  66.67 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6024  hypothetical protein  58.93 
 
 
120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3700  hypothetical protein  60.36 
 
 
119 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.27307  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0936  hypothetical protein  65.45 
 
 
118 aa  148  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12913  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0118  hypothetical protein  65.77 
 
 
117 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0219107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2319  hypothetical protein  58.04 
 
 
120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0648  hypothetical protein  63.96 
 
 
122 aa  144  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236963  normal  0.0853662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01710  hypothetical protein  60.71 
 
 
117 aa  144  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  0.513995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3395  hypothetical protein  63.96 
 
 
117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3198  hypothetical protein  63.06 
 
 
117 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0684  hypothetical protein  62.16 
 
 
116 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3293  hypothetical protein  62.16 
 
 
139 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2891  hypothetical protein  56.76 
 
 
116 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3322  hypothetical protein  61.26 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0463  hypothetical protein  53.57 
 
 
115 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0495  hypothetical protein  58.56 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2830  hypothetical protein  55.36 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00362163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1511  hypothetical protein  57.14 
 
 
122 aa  134  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.337807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3243  hypothetical protein  61.68 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06290  hypothetical protein  39.82 
 
 
125 aa  103  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>