26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4461 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4461  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3070  hypothetical protein  74.34 
 
 
113 aa  186  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2449  hypothetical protein  76.79 
 
 
122 aa  186  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000555956  normal  0.0107248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02580  hypothetical protein  73.21 
 
 
113 aa  177  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2452  hypothetical protein  73.87 
 
 
114 aa  177  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132241  hitchhiker  0.00000023892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0684  hypothetical protein  62.16 
 
 
116 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0118  hypothetical protein  66.67 
 
 
117 aa  156  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0219107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1004  hypothetical protein  63.06 
 
 
118 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5149  hypothetical protein  59.46 
 
 
116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3700  hypothetical protein  56.25 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.27307  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01710  hypothetical protein  63.39 
 
 
117 aa  150  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  0.513995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2319  hypothetical protein  60.71 
 
 
120 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6024  hypothetical protein  58.56 
 
 
120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0648  hypothetical protein  60.36 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236963  normal  0.0853662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0936  hypothetical protein  60 
 
 
118 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2891  hypothetical protein  54.05 
 
 
116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3395  hypothetical protein  56.76 
 
 
117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0495  hypothetical protein  60.36 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3198  hypothetical protein  56.76 
 
 
117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2830  hypothetical protein  56.25 
 
 
115 aa  137  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00362163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3293  hypothetical protein  56.76 
 
 
139 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0463  hypothetical protein  54.05 
 
 
115 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3322  hypothetical protein  54.05 
 
 
117 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1511  hypothetical protein  56.25 
 
 
122 aa  130  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.337807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3243  hypothetical protein  56.6 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06290  hypothetical protein  39.29 
 
 
125 aa  100  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>