26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2449 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2449  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  254  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000555956  normal  0.0107248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2452  hypothetical protein  73.21 
 
 
114 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132241  hitchhiker  0.00000023892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4461  hypothetical protein  76.79 
 
 
113 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3070  hypothetical protein  70.54 
 
 
113 aa  170  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02580  hypothetical protein  66.37 
 
 
113 aa  168  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0118  hypothetical protein  64.04 
 
 
117 aa  153  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0219107 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0936  hypothetical protein  63.39 
 
 
118 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12913  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5149  hypothetical protein  61.61 
 
 
116 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0684  hypothetical protein  61.61 
 
 
116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3293  hypothetical protein  63.96 
 
 
139 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3198  hypothetical protein  61.26 
 
 
117 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3395  hypothetical protein  60.36 
 
 
117 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3700  hypothetical protein  57.66 
 
 
119 aa  148  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.27307  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01710  hypothetical protein  61.61 
 
 
117 aa  147  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  0.513995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1004  hypothetical protein  58.93 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0648  hypothetical protein  55.83 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236963  normal  0.0853662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3322  hypothetical protein  57.66 
 
 
117 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2891  hypothetical protein  55.86 
 
 
116 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6024  hypothetical protein  54.46 
 
 
120 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2319  hypothetical protein  54.46 
 
 
120 aa  137  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3243  hypothetical protein  62.26 
 
 
108 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0495  hypothetical protein  57.52 
 
 
128 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2830  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00362163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0463  hypothetical protein  49.11 
 
 
115 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1511  hypothetical protein  52.68 
 
 
122 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.337807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06290  hypothetical protein  40.95 
 
 
125 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>