26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01710  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  244  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  0.513995 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0495  hypothetical protein  72.17 
 
 		 128 aa  174  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1004  hypothetical protein  63.48 
 
 		 118 aa  166  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0118  hypothetical protein  66.09 
 
 		 117 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0219107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3322  hypothetical protein  63.96 
 
 		 117 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2891  hypothetical protein  61.74 
 
 		 116 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3198  hypothetical protein  64.86 
 
 		 117 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1511  hypothetical protein  66.67 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.337807  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3293  hypothetical protein  63.06 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3395  hypothetical protein  62.16 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0648  hypothetical protein  58.97 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236963  normal  0.0853662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3700  hypothetical protein  58.26 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.27307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5149  hypothetical protein  59.13 
 
 		 116 aa  151  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2830  hypothetical protein  60.18 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00362163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0463  hypothetical protein  55.65 
 
 		 115 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3243  hypothetical protein  63.21 
 
 		 108 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0936  hypothetical protein  56.52 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0684  hypothetical protein  56.52 
 
 		 116 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2449  hypothetical protein  61.61 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000555956  normal  0.0107248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2452  hypothetical protein  61.06 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132241  hitchhiker  0.00000023892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02580  hypothetical protein  59.82 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3070  hypothetical protein  60.71 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4461  hypothetical protein  63.39 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2319  hypothetical protein  53.51 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6024  hypothetical protein  51.75 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06290  hypothetical protein  40.87 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>