26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0684 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0684  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  244  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173609 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5149  hypothetical protein  84.48 
 
 
116 aa  209  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0936  hypothetical protein  73.28 
 
 
118 aa  186  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12913  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0118  hypothetical protein  67.24 
 
 
117 aa  173  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0219107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0648  hypothetical protein  66.09 
 
 
122 aa  171  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236963  normal  0.0853662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3700  hypothetical protein  65.18 
 
 
119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.27307  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2891  hypothetical protein  61.21 
 
 
116 aa  158  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3293  hypothetical protein  62.28 
 
 
139 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2449  hypothetical protein  61.61 
 
 
122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000555956  normal  0.0107248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1004  hypothetical protein  58.62 
 
 
118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01710  hypothetical protein  56.52 
 
 
117 aa  148  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  0.513995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3395  hypothetical protein  57.89 
 
 
117 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4461  hypothetical protein  62.16 
 
 
113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3243  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0495  hypothetical protein  53.91 
 
 
128 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3198  hypothetical protein  56.14 
 
 
117 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3322  hypothetical protein  57.89 
 
 
117 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2452  hypothetical protein  58.04 
 
 
114 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132241  hitchhiker  0.00000023892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3070  hypothetical protein  62.16 
 
 
113 aa  142  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0463  hypothetical protein  52.17 
 
 
115 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2830  hypothetical protein  53.98 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00362163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02580  hypothetical protein  55.36 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2319  hypothetical protein  52.68 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6024  hypothetical protein  50.45 
 
 
120 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1511  hypothetical protein  48.65 
 
 
122 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.337807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06290  hypothetical protein  37.17 
 
 
125 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>