11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4360 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4360  hypothetical protein  100 
 
 		 719 aa  1455    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0384  hypothetical protein  49.66 
 
 		 730 aa  697    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.228891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  23.73 
 
 		 866 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  24.32 
 
 		 868 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  30.17 
 
 		 871 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  24.05 
 
 		 866 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2915  hypothetical protein  23.08 
 
 		 866 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.53 
 
 		 1255 aa  74.7  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0030  hypothetical protein  29.29 
 
 		 875 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1722  hypothetical protein  27.27 
 
 		 774 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1746  hypothetical protein  21.52 
 
 		 774 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.333719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>