13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1722 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 774 aa  1578    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1746  hypothetical protein  98.97 
 
 		 774 aa  1563    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.333719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  24.36 
 
 		 866 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  24.65 
 
 		 868 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  24.88 
 
 		 866 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0030  hypothetical protein  29.32 
 
 		 875 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  31.18 
 
 		 871 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2915  hypothetical protein  26.74 
 
 		 866 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0384  hypothetical protein  22.12 
 
 		 730 aa  77.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.228891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 719 aa  67.8  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  26.4 
 
 		 1255 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  29.55 
 
 		 850 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  41.67 
 
 		 763 aa  48.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>