86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2061 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2061  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 134 aa  277  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0265645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.33 
 
 		 134 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4348  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.27 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4432  lactoylglutathione lyase  55.81 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5249  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.96 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000066738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1750  hypothetical protein  58.06 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.94 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.97 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0884079  normal  0.141293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.31 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.225556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1430  hypothetical protein  50.81 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.384349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.13 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.22 
 
 		 140 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.67 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0454203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.67 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.990227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3250  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.03 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.395737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.77 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2565  hypothetical protein  48.78 
 
 		 132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1263  hypothetical protein  51.94 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.97 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0232716  normal  0.29911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2632  hypothetical protein  48.78 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3489  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.56 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.990759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2740  hypothetical protein  47.97 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7115  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.24 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0443  hypothetical protein  47.66 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.864422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0233  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2354  hypothetical protein  47.29 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3983  hypothetical protein  47.58 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.286993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.93 
 
 		 138 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0892969 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3933  hypothetical protein  47.33 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00670375  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  46.56 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1009  hypothetical protein  47.24 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.56 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4098  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.62 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0419  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.84 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08170  predicted lactoylglutathione lyase  44.8 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.913162  normal  0.0778281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1060  hypothetical protein  48.72 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4515  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.03 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0020  hypothetical protein  49.59 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.528781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2857  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.54 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000230287  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.41 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4550  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.41 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.482382  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.41 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2327  lactoylglutathione lyase  42.97 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200083  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6209  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.09 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.954751  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1706  lactoylglutathione lyase-like protein  39.52 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.54 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.42 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.48 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587684  normal  0.324112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1780  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.94 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630756  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1709  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.8 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.54 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4499  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0899867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4926  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.22 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0545441 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1420  hypothetical protein  35.34 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0362155  normal  0.0872758 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1441  hypothetical protein  36.43 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.33915  decreased coverage  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2818  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4147  putative glyoxalase family protein  43.12 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21560  predicted lactoylglutathione lyase  29.69 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.82 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3728  glyoxalase family protein  29.46 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4416  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.47 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3083  glyoxalase family protein  27.2 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2653  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5184  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 213 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2342  hypothetical protein  27.2 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3394  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6100  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 		 143 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 		 211 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.64 
 
 		 139 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.728322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5362  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.243786  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3214  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 		 277 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000855792  normal  0.159914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>