79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3489 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3489  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
140 aa  288  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.990759  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2061  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.75 
 
 
134 aa  147  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0265645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.94 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.92 
 
 
137 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4432  lactoylglutathione lyase  45.8 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.28 
 
 
141 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0454203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3250  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.37 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.395737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4348  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  42.54 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3933  hypothetical protein  42.11 
 
 
141 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00670375  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.55 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.225556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.31 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0884079  normal  0.141293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1750  hypothetical protein  44.8 
 
 
135 aa  110  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634592  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.86 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0232716  normal  0.29911 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0443  hypothetical protein  40.16 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.864422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.75 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7115  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.06 
 
 
135 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599769  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.45 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4499  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.71 
 
 
137 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0899867  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.48 
 
 
141 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2857  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
144 aa  103  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000230287  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0233  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.93 
 
 
135 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4515  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.41 
 
 
138 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.86 
 
 
138 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.384349  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.31 
 
 
135 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.990227  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5249  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.37 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000066738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2565  hypothetical protein  38.4 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1430  hypothetical protein  35.16 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1706  lactoylglutathione lyase-like protein  34.68 
 
 
136 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2632  hypothetical protein  38.4 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4098  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.3 
 
 
139 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1780  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.06 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630756  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2740  hypothetical protein  37.6 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2354  hypothetical protein  37.69 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1009  hypothetical protein  38.76 
 
 
143 aa  94.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1263  hypothetical protein  36.92 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3983  hypothetical protein  37.1 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.286993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6209  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.97 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.954751  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1060  hypothetical protein  40.17 
 
 
121 aa  92  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.41 
 
 
140 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08170  predicted lactoylglutathione lyase  35.34 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.913162  normal  0.0778281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2327  lactoylglutathione lyase  35.94 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200083  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.48 
 
 
144 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.35 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0892969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1709  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.28 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0419  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.76 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4550  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.482382  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.11 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587684  normal  0.324112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.41 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1420  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0362155  normal  0.0872758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0020  hypothetical protein  39.1 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.528781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.17 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.33915  decreased coverage  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4926  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.82 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0545441 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1441  hypothetical protein  29.01 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4147  putative glyoxalase family protein  38.89 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2818  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21560  predicted lactoylglutathione lyase  27.78 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.62 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0775  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.37 
 
 
125 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1252  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 
211 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.55 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2799  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.83 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.568306  normal  0.501326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2342  hypothetical protein  29.92 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3728  glyoxalase family protein  27.69 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.81 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5362  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>