93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3250 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3250  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.395737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1009  hypothetical protein  59.56 
 
 
143 aa  176  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08170  predicted lactoylglutathione lyase  54.89 
 
 
144 aa  144  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.913162  normal  0.0778281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2061  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.03 
 
 
134 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0265645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.15 
 
 
138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.384349  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.89 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7115  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.15 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599769  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0233  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.89 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4348  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.79 
 
 
154 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.15 
 
 
135 aa  130  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.990227  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5249  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.91 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000066738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.37 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0454203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6209  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.82 
 
 
147 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.954751  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.46 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.225556 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.71 
 
 
138 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.29 
 
 
137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.12 
 
 
141 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.67 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0892969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.12 
 
 
134 aa  123  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4098  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.48 
 
 
139 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0443  hypothetical protein  46.15 
 
 
135 aa  120  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.864422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.21 
 
 
136 aa  120  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0884079  normal  0.141293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2857  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.76 
 
 
144 aa  117  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000230287  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3983  hypothetical protein  43.57 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.286993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1430  hypothetical protein  46.51 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4515  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2565  hypothetical protein  46.46 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1750  hypothetical protein  45.93 
 
 
135 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634592  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2740  hypothetical protein  46.46 
 
 
132 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2632  hypothetical protein  46.46 
 
 
132 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  44.44 
 
 
141 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4432  lactoylglutathione lyase  43.28 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2354  hypothetical protein  42.22 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.65 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.41 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3933  hypothetical protein  42.96 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00670375  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.03 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0232716  normal  0.29911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.48 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.7 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4550  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.48 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.482382  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.48 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 
138 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587684  normal  0.324112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3489  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.4 
 
 
140 aa  106  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.990759  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1706  lactoylglutathione lyase-like protein  37.5 
 
 
136 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4499  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.04 
 
 
137 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0899867  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0020  hypothetical protein  45.59 
 
 
137 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.528781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4926  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.93 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0545441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0419  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.54 
 
 
133 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2327  lactoylglutathione lyase  42.97 
 
 
135 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200083  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1060  hypothetical protein  42.5 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.93 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1263  hypothetical protein  40.3 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.88 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.28 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1709  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.69 
 
 
135 aa  89.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1780  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.3 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630756  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1420  hypothetical protein  37.4 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0362155  normal  0.0872758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4147  putative glyoxalase family protein  46.43 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.33915  decreased coverage  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1441  hypothetical protein  33.83 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21560  predicted lactoylglutathione lyase  33.82 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.79 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2818  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3728  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1252  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.392689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2038  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
143 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0779  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.79 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3083  glyoxalase family protein  27.87 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.8 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3319  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4393  glyoxalase/bleomycin resistance protein dioxygenase superfamily protein  28.68 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2342  hypothetical protein  28.46 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.243786  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1945  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869019  hitchhiker  0.00300875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3475  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1215  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.97 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.743705  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.68 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.728322  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
132 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.66 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58620  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3902  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2713  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 
130 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3394  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
138 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>