69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1009 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1009  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  297  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3250  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.56 
 
 
141 aa  176  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.395737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.46 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.225556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08170  predicted lactoylglutathione lyase  47.29 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.913162  normal  0.0778281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3983  hypothetical protein  43.8 
 
 
139 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.286993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.48 
 
 
135 aa  133  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.990227  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7115  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.7 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599769  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5249  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.2 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000066738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.51 
 
 
144 aa  130  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0454203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4348  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.58 
 
 
154 aa  130  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.29 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.384349  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0233  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.7 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4098  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.57 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.51 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.75 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.33 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.19 
 
 
140 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.33 
 
 
146 aa  124  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0232716  normal  0.29911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4432  lactoylglutathione lyase  44.27 
 
 
135 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2354  hypothetical protein  43.18 
 
 
134 aa  123  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.36 
 
 
137 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2061  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.24 
 
 
134 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0265645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0443  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  120  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.864422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6209  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.48 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.954751  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1060  hypothetical protein  45.83 
 
 
121 aa  118  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0884079  normal  0.141293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0020  hypothetical protein  47.37 
 
 
137 aa  117  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.528781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 
134 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1750  hypothetical protein  42.19 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634592  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.74 
 
 
138 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0892969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1430  hypothetical protein  40.62 
 
 
132 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0419  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.31 
 
 
133 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2565  hypothetical protein  41.73 
 
 
132 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1706  lactoylglutathione lyase-like protein  34.09 
 
 
136 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  42.65 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.65 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2632  hypothetical protein  41.73 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2740  hypothetical protein  40.94 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2857  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.24 
 
 
144 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000230287  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4515  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.1 
 
 
138 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1263  hypothetical protein  41.54 
 
 
137 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3933  hypothetical protein  39.69 
 
 
141 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00670375  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2327  lactoylglutathione lyase  35.82 
 
 
135 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200083  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
138 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4550  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
138 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.482382  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
138 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1709  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.5 
 
 
135 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 
138 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4926  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.59 
 
 
138 aa  97.1  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0545441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.56 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587684  normal  0.324112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.15 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1780  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 
135 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630756  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4499  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.3 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0899867  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1420  hypothetical protein  32.85 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0362155  normal  0.0872758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.57 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3489  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.990759  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.03 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4147  putative glyoxalase family protein  38.53 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1441  hypothetical protein  31.06 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21560  predicted lactoylglutathione lyase  36.72 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.33915  decreased coverage  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.56 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.82 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.392689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.89 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>