23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1734 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1734  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00739369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2109  hypothetical protein  59.54 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2351  hypothetical protein  58.02 
 
 		 132 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368113 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4955  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.759511  normal  0.0203033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1415  Polyketide cyclase/dehydrase  51.61 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1617  hypothetical protein  47.33 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3929  hypothetical protein  48.8 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.885307  normal  0.975733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3539  hypothetical protein  49.21 
 
 		 135 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3263  hypothetical protein  48.03 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2633  hypothetical protein  47.66 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19310  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  44.62 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3291  hypothetical protein  44.12 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3613  hypothetical protein  43.38 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11940  hypothetical protein  42.75 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3146  hypothetical protein  41.48 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0787309  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3086  hypothetical protein  41.48 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2790  Polyketide cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2633  hypothetical protein  37.17 
 
 		 195 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3106  hypothetical protein  40.68 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557305  normal  0.665804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2287  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134946 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0711  hypothetical protein  27.91 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.18 
 
 		 274 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  29.22 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>