20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2633 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2633  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  267  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19310  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  57.36 
 
 
133 aa  146  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140602  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2790  Polyketide cyclase/dehydrase  66.4 
 
 
134 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1617  hypothetical protein  53.23 
 
 
132 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3929  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.885307  normal  0.975733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1415  Polyketide cyclase/dehydrase  48.03 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1734  hypothetical protein  47.66 
 
 
148 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00739369  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3086  hypothetical protein  50.76 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3146  hypothetical protein  50.76 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0787309  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2351  hypothetical protein  44.96 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11940  hypothetical protein  49.21 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2109  hypothetical protein  44.19 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3106  hypothetical protein  52.38 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557305  normal  0.665804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4955  hypothetical protein  41.54 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.759511  normal  0.0203033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2633  hypothetical protein  43.12 
 
 
195 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343714  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3539  hypothetical protein  38.89 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3263  hypothetical protein  37.98 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455333  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3291  hypothetical protein  35.71 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3613  hypothetical protein  32.86 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.8 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>