20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2790 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2790  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
134 aa  266  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2633  hypothetical protein  66.4 
 
 
132 aa  161  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1415  Polyketide cyclase/dehydrase  53.73 
 
 
150 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1617  hypothetical protein  52 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19310  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  54.39 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140602  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3929  hypothetical protein  49.6 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.885307  normal  0.975733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3086  hypothetical protein  51.54 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3146  hypothetical protein  51.54 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0787309  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11940  hypothetical protein  48.82 
 
 
162 aa  102  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1734  hypothetical protein  43.75 
 
 
148 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00739369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3106  hypothetical protein  51.54 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557305  normal  0.665804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2351  hypothetical protein  41.96 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2109  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3613  hypothetical protein  42.28 
 
 
143 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2633  hypothetical protein  44.9 
 
 
195 aa  83.6  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343714  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4955  hypothetical protein  41.96 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.759511  normal  0.0203033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3291  hypothetical protein  42.28 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3263  hypothetical protein  38.58 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3539  hypothetical protein  40.54 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0711  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>