21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2109 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2109  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  275  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2351  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  260  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1734  hypothetical protein  59.54 
 
 
148 aa  170  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00739369  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1617  hypothetical protein  52.27 
 
 
132 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1415  Polyketide cyclase/dehydrase  50.39 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4955  hypothetical protein  48.82 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.759511  normal  0.0203033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3929  hypothetical protein  48.39 
 
 
133 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.885307  normal  0.975733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3539  hypothetical protein  46.51 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3263  hypothetical protein  44.03 
 
 
135 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455333  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19310  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  43.41 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140602  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11940  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3086  hypothetical protein  50.86 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2633  hypothetical protein  44.19 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3146  hypothetical protein  50.86 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0787309  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3291  hypothetical protein  44.85 
 
 
143 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3613  hypothetical protein  41.91 
 
 
143 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2633  hypothetical protein  45.92 
 
 
195 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343714  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3106  hypothetical protein  51.55 
 
 
136 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557305  normal  0.665804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2790  Polyketide cyclase/dehydrase  44.58 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2287  hypothetical protein  25.71 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134946 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0711  hypothetical protein  28.24 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>