21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2633 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2633  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343714  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3929  hypothetical protein  49.55 
 
 
133 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.885307  normal  0.975733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1617  hypothetical protein  45.13 
 
 
132 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2109  hypothetical protein  45.92 
 
 
132 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2351  hypothetical protein  44.9 
 
 
132 aa  97.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11940  hypothetical protein  46.85 
 
 
162 aa  94.4  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1415  Polyketide cyclase/dehydrase  44.14 
 
 
150 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19310  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  42.34 
 
 
133 aa  92.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140602  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3086  hypothetical protein  43.36 
 
 
136 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3146  hypothetical protein  43.36 
 
 
136 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0787309  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2633  hypothetical protein  43.12 
 
 
132 aa  85.9  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1734  hypothetical protein  37.17 
 
 
148 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00739369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3106  hypothetical protein  41.82 
 
 
136 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557305  normal  0.665804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4955  hypothetical protein  39.09 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.759511  normal  0.0203033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2790  Polyketide cyclase/dehydrase  46.43 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3263  hypothetical protein  37.27 
 
 
135 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3539  hypothetical protein  32.74 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3613  hypothetical protein  30.08 
 
 
143 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3291  hypothetical protein  30.08 
 
 
143 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.56 
 
 
274 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2287  hypothetical protein  33.03 
 
 
139 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>