13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_R0060 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_R0060  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000227715  normal  0.912821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>