10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0014 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0001  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000393135  normal  0.385649 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-2  tRNA-Val  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000334583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_966  tRNA-Val  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00216309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0040  tRNA-Val  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0042  tRNA-Val  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206576  normal  0.0624418 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0012  tRNA-Val  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0018  tRNA-Val  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0033  tRNA-Val  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.929932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>