20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3301 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1182    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  33.33 
 
 
538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  33.89 
 
 
491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  30.93 
 
 
542 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  29.39 
 
 
271 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  29.39 
 
 
271 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  33.61 
 
 
537 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  30.33 
 
 
547 aa  107  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  34.96 
 
 
562 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  27.1 
 
 
725 aa  98.2  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  32.82 
 
 
518 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  29.85 
 
 
555 aa  91.3  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  26.73 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  24.41 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0217  hypothetical protein  22.7 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  25.59 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  27.96 
 
 
342 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  25.68 
 
 
570 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  23.32 
 
 
569 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  24.62 
 
 
376 aa  54.7  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>