19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2247 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1156    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  29.34 
 
 
569 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  45.38 
 
 
380 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  41.99 
 
 
372 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  40.44 
 
 
348 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  30.75 
 
 
342 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  28.29 
 
 
555 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  33.92 
 
 
376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  22.28 
 
 
538 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  27.97 
 
 
491 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  27.88 
 
 
271 aa  87.4  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  27.88 
 
 
271 aa  87.4  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  29.27 
 
 
542 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  29.86 
 
 
547 aa  83.6  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  30.09 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  25.49 
 
 
518 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  27.23 
 
 
725 aa  72  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  26.24 
 
 
586 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  25.83 
 
 
562 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>