20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0329 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  766    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  42.62 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  39.14 
 
 		 342 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  41.13 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  34.15 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  39.74 
 
 		 569 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  42.4 
 
 		 570 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  36.18 
 
 		 555 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  25.55 
 
 		 538 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  25.69 
 
 		 491 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  28.68 
 
 		 542 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  27.93 
 
 		 725 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  26.34 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  24.03 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  24.41 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  28.42 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  28.42 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  28 
 
 		 518 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  27.97 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  36.59 
 
 		 1906 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>