19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2378 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  698    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  43.32 
 
 
348 aa  296  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  39.14 
 
 
372 aa  268  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  32.28 
 
 
376 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  34.01 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  30.84 
 
 
570 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  36.78 
 
 
569 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  33.17 
 
 
555 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  28.06 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  28.06 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  26.09 
 
 
538 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  28.5 
 
 
725 aa  79.7  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  26.5 
 
 
547 aa  72.8  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  26.67 
 
 
518 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  26.27 
 
 
586 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  24.74 
 
 
542 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  26.37 
 
 
537 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  24.87 
 
 
562 aa  59.7  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  20.71 
 
 
491 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>