40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_21090  phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.826338  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  36.67 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.07 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15060  phosphopantetheinyl transferase  47.71 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.112018  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.12 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.87 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.61 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.32 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.61 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1855  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.48 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0000151687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.55 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.68 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1742  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.07 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000109454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.32 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.14 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.96 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  32.47 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3071  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.45 
 
 
218 aa  52  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.956494  normal  0.265144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  30.27 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19150  phosphopantetheinyl transferase  35.1 
 
 
379 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.34 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0108837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.18 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.32 
 
 
294 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.11 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.86 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3102  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.99 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.26 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.9 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.19 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1493  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.91 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000529438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.68 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  35.29 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.53 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>