18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04100  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  527  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0820213  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  29.81 
 
 
405 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  27.81 
 
 
619 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  29.01 
 
 
364 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  28.29 
 
 
388 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  28.29 
 
 
388 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  28.29 
 
 
388 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  27.34 
 
 
362 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  25.55 
 
 
418 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  26.14 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  26.69 
 
 
478 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  31.29 
 
 
544 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  31.76 
 
 
665 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.92 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  28.89 
 
 
926 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  27.42 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  27.82 
 
 
1132 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>