More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_01940  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
288 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1712  fructose-bisphosphate aldolase  62.82 
 
 
279 aa  347  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1163  Tagatose-bisphosphate aldolase  58.12 
 
 
274 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16610  fructose-bisphosphate aldolase  59.34 
 
 
278 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3536  Fructose-bisphosphate aldolase  55.23 
 
 
278 aa  269  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2358  ketose-bisphosphate aldolase  53.99 
 
 
278 aa  269  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0595665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2157  ketose-bisphosphate aldolase  63.3 
 
 
281 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5906  ketose-bisphosphate aldolase  54.77 
 
 
292 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6207  Tagatose-bisphosphate aldolase  55.92 
 
 
280 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30365 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.5 
 
 
284 aa  225  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  43.21 
 
 
284 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  39.79 
 
 
308 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.64 
 
 
284 aa  208  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.43 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  45 
 
 
287 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.07 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40 
 
 
284 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  38.13 
 
 
283 aa  195  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.07 
 
 
286 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  37.41 
 
 
283 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  40.71 
 
 
287 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.36 
 
 
307 aa  191  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.68 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.62 
 
 
323 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  36.07 
 
 
284 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  39.43 
 
 
285 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
285 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  40.14 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  40.14 
 
 
285 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  37.74 
 
 
285 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  38.21 
 
 
287 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  36.07 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  37.67 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  37.36 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  37.74 
 
 
281 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  40.82 
 
 
283 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.99 
 
 
307 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  37.55 
 
 
292 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  36.88 
 
 
284 aa  178  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  39.29 
 
 
284 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.8 
 
 
307 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  35.84 
 
 
286 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  35.84 
 
 
286 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.93 
 
 
308 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 
330 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 
330 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 
330 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 
330 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  36.8 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  36.56 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  38.49 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  37.17 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.3 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  37.17 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  36.68 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  37.17 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  34.35 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  36.06 
 
 
284 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  35.29 
 
 
281 aa  170  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  38.79 
 
 
280 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.5 
 
 
313 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2033  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.69 
 
 
325 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000857052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  35.69 
 
 
284 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 
284 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 
284 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 
284 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.18 
 
 
313 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.56 
 
 
311 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 
284 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  35.32 
 
 
284 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  35.32 
 
 
286 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  33.67 
 
 
327 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  35.61 
 
 
283 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  35.32 
 
 
284 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  37.33 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.05 
 
 
328 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3438  ketose-bisphosphate aldolase  40.86 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0588169  hitchhiker  0.000131538 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.64 
 
 
312 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  35.32 
 
 
284 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  35.32 
 
 
286 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  35.32 
 
 
286 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.31 
 
 
309 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  35.32 
 
 
286 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  35.32 
 
 
286 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  35.32 
 
 
286 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  35.32 
 
 
286 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  35.49 
 
 
293 aa  166  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  35.32 
 
 
286 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4019  ketose-bisphosphate aldolase  37.05 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.74 
 
 
354 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.74 
 
 
354 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  40.23 
 
 
281 aa  165  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>