More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2157 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2157  ketose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
281 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1712  fructose-bisphosphate aldolase  59.56 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1163  Tagatose-bisphosphate aldolase  65.81 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01940  fructose-bisphosphate aldolase  63.77 
 
 
288 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2358  ketose-bisphosphate aldolase  64.81 
 
 
278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0595665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3536  Fructose-bisphosphate aldolase  62.02 
 
 
278 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16610  fructose-bisphosphate aldolase  62.45 
 
 
278 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6207  Tagatose-bisphosphate aldolase  57.89 
 
 
280 aa  252  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5906  ketose-bisphosphate aldolase  55.17 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  42.49 
 
 
308 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.04 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.59 
 
 
286 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  42.12 
 
 
284 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  37.32 
 
 
283 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.56 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.93 
 
 
284 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  42.18 
 
 
281 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  37.41 
 
 
284 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.19 
 
 
287 aa  188  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.63 
 
 
284 aa  188  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  37.41 
 
 
284 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  37.41 
 
 
284 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.19 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.93 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.75 
 
 
288 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.81 
 
 
309 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.57 
 
 
284 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  40.61 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  36.43 
 
 
283 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  38.43 
 
 
287 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  38.43 
 
 
285 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  38.29 
 
 
285 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  37.45 
 
 
284 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  37.45 
 
 
284 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  37.45 
 
 
284 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  37.45 
 
 
284 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
285 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  37.45 
 
 
284 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  37.45 
 
 
284 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  39.1 
 
 
307 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  37.08 
 
 
284 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  37.08 
 
 
284 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  37.72 
 
 
324 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  37.92 
 
 
285 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.64 
 
 
307 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  37.08 
 
 
284 aa  175  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  37.08 
 
 
284 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl644  fructose-biphosphate aldolase  34.75 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.35 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  38.06 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.29 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  37.45 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  36.21 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  38.22 
 
 
281 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  35.9 
 
 
287 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  38.29 
 
 
284 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.02 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.47 
 
 
305 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  35.71 
 
 
284 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  36.7 
 
 
324 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.86 
 
 
323 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  36.36 
 
 
324 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  35.85 
 
 
286 aa  169  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  36.33 
 
 
324 aa  169  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.41 
 
 
307 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1705  ketose-bisphosphate aldolase  38.22 
 
 
274 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  37.36 
 
 
292 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  37.36 
 
 
286 aa  168  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  32.61 
 
 
281 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  38.08 
 
 
287 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  37.36 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  37.36 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  37.36 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  37.36 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  37.36 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  37.36 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  37.36 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2058  fructose-bisphosphate aldolase, class II  36.33 
 
 
278 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  hitchhiker  0.00173454 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  33.96 
 
 
281 aa  166  4e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0353  fructose-bisphosphate aldolase  37.45 
 
 
325 aa  166  4e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.198569  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1456  ketose-bisphosphate aldolase  40.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  36.47 
 
 
283 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  34.72 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  34.72 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  36.33 
 
 
374 aa  165  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  36.75 
 
 
293 aa  165  8e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  36.33 
 
 
324 aa  165  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  38.67 
 
 
295 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  36.43 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  36.43 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  37.02 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468946  unclonable  0.00000168547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  40.67 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>