More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0690 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3257  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  287  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000119388  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0690  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  287  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00390945  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0704  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  287  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000907287  hitchhiker  0.000477361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  98 
 
 		 150 aa  283  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  87.92 
 
 		 150 aa  261  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  87.92 
 
 		 150 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  85.91 
 
 		 150 aa  253  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0756  50S ribosomal protein L9  96 
 
 		 150 aa  253  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3583  50S ribosomal protein L9  88 
 
 		 150 aa  240  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3061  50S ribosomal protein L9  95.62 
 
 		 149 aa  230  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  82 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3640  50S ribosomal protein L9  95.59 
 
 		 150 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00911662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0735  50S ribosomal protein L9  94.85 
 
 		 150 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0626075  hitchhiker  0.0000000116035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0714  50S ribosomal protein L9  94.85 
 
 		 150 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.494511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0744  50S ribosomal protein L9  94.85 
 
 		 150 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00359024  hitchhiker  0.000144513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  75.68 
 
 		 150 aa  223  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  77.18 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  73.65 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  76.51 
 
 		 149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  76.51 
 
 		 149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0518  50S ribosomal protein L9  87.5 
 
 		 150 aa  218  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497123  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  75.84 
 
 		 149 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  75.84 
 
 		 149 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  75.84 
 
 		 149 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  72.48 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  70 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  70 
 
 		 150 aa  210  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  73.15 
 
 		 149 aa  207  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  72 
 
 		 150 aa  207  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  72 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  72 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  72 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  70.67 
 
 		 150 aa  201  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3432  50S ribosomal protein L9  72.67 
 
 		 150 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0374  50S ribosomal protein L9  73.83 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0230672  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  64.43 
 
 		 149 aa  193  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2763  50S ribosomal protein L9  71.62 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3744  50S ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 150 aa  186  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00940058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  65.54 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0797  50S ribosomal protein L9  73.33 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000346105  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  57.72 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  59.18 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  58.39 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  62.04 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  62.04 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3422  ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0926  ribosomal protein L9  65.1 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4874  50S ribosomal protein L9  62.77 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4755  50S ribosomal protein L9  62.77 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5659  50S ribosomal protein L9  63.76 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65150  50S ribosomal protein L9  63.76 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  57.33 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0891  50S ribosomal protein L9P  59.06 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4930  ribosomal protein L9  65.22 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.958603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0584  50S ribosomal protein L9  65.22 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  61.74 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0537  50S ribosomal protein L9  63.7 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  54 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  56.08 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  62.25 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  55.03 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1059  LSU ribosomal protein L9P / transcriptional regulator GntR family protein  57.78 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3462  ribosomal protein L9  56.38 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  56.93 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  51.33 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  52.05 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  52.05 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2035  ribosomal protein L9  56.38 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0820027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  52.35 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 166 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  51.01 
 
 		 170 aa  136  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1932  ribosomal protein L9  60.14 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  50 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  50.36 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0930  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  51.85 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1084  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00450273  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  53.02 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>