18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0977 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0977  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1015  hypothetical protein  95.03 
 
 		 322 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0981  hypothetical protein  92.24 
 
 		 322 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1154  hypothetical protein  76.56 
 
 		 330 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1068  hypothetical protein  66.87 
 
 		 319 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00493933  normal  0.0171581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3511  hypothetical protein  67.78 
 
 		 313 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.529313  hitchhiker  0.00454263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3290  hypothetical protein  66.87 
 
 		 319 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3386  hypothetical protein  66.27 
 
 		 319 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.022865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2928  hypothetical protein  67.49 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3780  hypothetical protein  57.8 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0692  hypothetical protein  57.66 
 
 		 306 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0802  hypothetical protein  55.73 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3426  hypothetical protein  52.2 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103182  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1618  hypothetical protein  45.71 
 
 		 286 aa  278  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1861  hypothetical protein  49.17 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3261  hypothetical protein  46.86 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0739  hypothetical protein  47.19 
 
 		 291 aa  231  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1112  hypothetical protein  24.2 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>