17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1861 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1861  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1618  hypothetical protein  50 
 
 		 286 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2928  hypothetical protein  47.78 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0981  hypothetical protein  48.67 
 
 		 322 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0977  hypothetical protein  49.17 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1015  hypothetical protein  48.33 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0802  hypothetical protein  47.21 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3780  hypothetical protein  45.48 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1154  hypothetical protein  47.76 
 
 		 330 aa  258  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3511  hypothetical protein  44.98 
 
 		 313 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.529313  hitchhiker  0.00454263 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1068  hypothetical protein  44.48 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00493933  normal  0.0171581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3290  hypothetical protein  45.18 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3386  hypothetical protein  44.18 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.022865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0692  hypothetical protein  43.56 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3426  hypothetical protein  41.74 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3261  hypothetical protein  39.32 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0739  hypothetical protein  41.58 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>