18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1618 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1618  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  593  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1861  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3780  hypothetical protein  48.69 
 
 
303 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0802  hypothetical protein  49.16 
 
 
296 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1015  hypothetical protein  47.09 
 
 
322 aa  278  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0977  hypothetical protein  45.71 
 
 
322 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3426  hypothetical protein  45.96 
 
 
320 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1068  hypothetical protein  45.99 
 
 
319 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00493933  normal  0.0171581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0981  hypothetical protein  48.31 
 
 
322 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0692  hypothetical protein  47.57 
 
 
306 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3511  hypothetical protein  45.74 
 
 
313 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.529313  hitchhiker  0.00454263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2928  hypothetical protein  47.6 
 
 
309 aa  275  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3290  hypothetical protein  45.2 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3386  hypothetical protein  45.37 
 
 
319 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.022865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1154  hypothetical protein  46.18 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3261  hypothetical protein  41.46 
 
 
282 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0918526  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0739  hypothetical protein  41.58 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1112  hypothetical protein  24.48 
 
 
300 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>