18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0802 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0802  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3780  hypothetical protein  66.01 
 
 
303 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3426  hypothetical protein  58.93 
 
 
320 aa  374  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0692  hypothetical protein  58.17 
 
 
306 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2928  hypothetical protein  59.35 
 
 
309 aa  359  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3290  hypothetical protein  57.81 
 
 
319 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3511  hypothetical protein  57.41 
 
 
313 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.529313  hitchhiker  0.00454263 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1068  hypothetical protein  56.52 
 
 
319 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00493933  normal  0.0171581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3386  hypothetical protein  56.83 
 
 
319 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.022865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0981  hypothetical protein  56.44 
 
 
322 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1015  hypothetical protein  56.35 
 
 
322 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1154  hypothetical protein  56.19 
 
 
330 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0977  hypothetical protein  56.66 
 
 
322 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3261  hypothetical protein  50.51 
 
 
282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0918526  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1618  hypothetical protein  49.16 
 
 
286 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1861  hypothetical protein  48.18 
 
 
296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0739  hypothetical protein  46.31 
 
 
291 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1112  hypothetical protein  24.91 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>