18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1154 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  684    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0981  hypothetical protein  78.18 
 
 		 322 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0977  hypothetical protein  76.56 
 
 		 322 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1015  hypothetical protein  77.27 
 
 		 322 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1068  hypothetical protein  65.58 
 
 		 319 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00493933  normal  0.0171581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3511  hypothetical protein  66.47 
 
 		 313 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.529313  hitchhiker  0.00454263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2928  hypothetical protein  65.29 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3386  hypothetical protein  64.99 
 
 		 319 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.022865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3290  hypothetical protein  64.99 
 
 		 319 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3780  hypothetical protein  55.56 
 
 		 303 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0692  hypothetical protein  55.72 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0802  hypothetical protein  55.29 
 
 		 296 aa  338  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3426  hypothetical protein  51.31 
 
 		 320 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103182  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1618  hypothetical protein  46.18 
 
 		 286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3261  hypothetical protein  45.73 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1861  hypothetical protein  47.76 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0739  hypothetical protein  46.41 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1112  hypothetical protein  21.25 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>