14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0043 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.606143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2455  hypothetical protein  55.36 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.703231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4517  hypothetical protein  57.14 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2267  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.223859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2770  hypothetical protein  55.36 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0830  hypothetical protein  53.57 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4979  hypothetical protein  51.72 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3970  hypothetical protein  53.57 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4309  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1357  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1345  hypothetical protein  61.54 
 
 		 47 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4257  hypothetical protein  56.1 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2246  hypothetical protein  58.97 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.7656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2238  hypothetical protein  44.9 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.527619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>