12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2238 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4309  hypothetical protein  44.78 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0140  hypothetical protein  74.19 
 
 		 31 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2267  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.223859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2770  hypothetical protein  43.28 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4979  hypothetical protein  43.28 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1263  hypothetical protein  70.97 
 
 		 31 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4517  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0043  hypothetical protein  44.9 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.606143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2455  hypothetical protein  41.79 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.703231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0830  hypothetical protein  40.3 
 
 		 70 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3970  hypothetical protein  38.81 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>