17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4979 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4979  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  143  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2455  hypothetical protein  89.71 
 
 
77 aa  126  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.703231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2267  hypothetical protein  91.04 
 
 
70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.223859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4309  hypothetical protein  88.24 
 
 
73 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2770  hypothetical protein  88.06 
 
 
75 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3970  hypothetical protein  86.76 
 
 
74 aa  120  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0830  hypothetical protein  86.76 
 
 
70 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4517  hypothetical protein  83.82 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1357  hypothetical protein  83.58 
 
 
67 aa  113  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1345  hypothetical protein  90 
 
 
47 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2246  hypothetical protein  85.37 
 
 
57 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.7656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4257  hypothetical protein  77.5 
 
 
73 aa  67  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0043  hypothetical protein  51.72 
 
 
62 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.606143  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0293  hypothetical protein  82.35 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.96485  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2476  hypothetical protein  79.41 
 
 
54 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2238  hypothetical protein  43.28 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2245  hypothetical protein  64.86 
 
 
43 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>