13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4257 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4257  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  152  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2455  hypothetical protein  80 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.703231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1345  hypothetical protein  82.5 
 
 
47 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2246  hypothetical protein  74.42 
 
 
57 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.7656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2770  hypothetical protein  80 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0830  hypothetical protein  81.58 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4979  hypothetical protein  77.5 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3970  hypothetical protein  71.43 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2267  hypothetical protein  73.17 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.223859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4517  hypothetical protein  69.77 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4309  hypothetical protein  75 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1357  hypothetical protein  70 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0043  hypothetical protein  56.1 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.606143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>