13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1345 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1345  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  100  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2770  hypothetical protein  95 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0830  hypothetical protein  92.5 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4309  hypothetical protein  80.43 
 
 
73 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2455  hypothetical protein  90 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.703231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4979  hypothetical protein  90 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2246  hypothetical protein  90 
 
 
57 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.7656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3970  hypothetical protein  87.5 
 
 
74 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4517  hypothetical protein  87.5 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2267  hypothetical protein  85 
 
 
70 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.223859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4257  hypothetical protein  82.5 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1357  hypothetical protein  80 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0043  hypothetical protein  61.54 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.606143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>