17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3970 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3970  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  153  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0830  hypothetical protein  90 
 
 
70 aa  127  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2770  hypothetical protein  83.56 
 
 
75 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2455  hypothetical protein  86.76 
 
 
77 aa  123  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.703231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4517  hypothetical protein  85.51 
 
 
95 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4979  hypothetical protein  86.76 
 
 
69 aa  120  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1357  hypothetical protein  86.57 
 
 
67 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4309  hypothetical protein  78.08 
 
 
73 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2267  hypothetical protein  85.07 
 
 
70 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.223859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2246  hypothetical protein  81.4 
 
 
57 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.7656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1345  hypothetical protein  87.5 
 
 
47 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4257  hypothetical protein  71.43 
 
 
73 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0043  hypothetical protein  53.57 
 
 
62 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.606143  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2476  hypothetical protein  76.47 
 
 
54 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0293  hypothetical protein  76.47 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.96485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2245  hypothetical protein  78.57 
 
 
43 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2238  hypothetical protein  38.81 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.527619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>