11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17230  predicted membrane protein  100 
 
 		 383 aa  783    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.451022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0972  hypothetical protein  28.46 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2862  hypothetical protein  25.07 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0121665  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3020  hypothetical protein  27.7 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0651  hypothetical protein  22.07 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4271  hypothetical protein  25.33 
 
 		 348 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.990265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3390  hypothetical protein  27.08 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1967  hypothetical protein  27.12 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72287  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2471  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2179  hypothetical protein  26.97 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117736  hitchhiker  0.00445962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6675  hypothetical protein  27.86 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>