13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0972 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0972  hypothetical protein  100 
 
 
516 aa  1009    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0651  hypothetical protein  56.8 
 
 
424 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2862  hypothetical protein  36.84 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0121665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0515  hypothetical protein  27.95 
 
 
405 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.968569  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0625  hypothetical protein  26.42 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0189  hypothetical protein  26.99 
 
 
333 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0604161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0499  hypothetical protein  25.87 
 
 
340 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.508303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17230  predicted membrane protein  28.79 
 
 
383 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.451022  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0669  hypothetical protein  24.8 
 
 
349 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1771  hypothetical protein  28.65 
 
 
369 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3942  hypothetical protein  26.9 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32994  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0778  hypothetical protein  22.48 
 
 
333 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3390  hypothetical protein  26.01 
 
 
348 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>