13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2862 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2862  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  805    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0121665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0972  hypothetical protein  37.94 
 
 
516 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0651  hypothetical protein  36.7 
 
 
424 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0515  hypothetical protein  31.13 
 
 
405 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.968569  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0499  hypothetical protein  23.46 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.508303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0669  hypothetical protein  25.6 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4271  hypothetical protein  31.06 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.990265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0189  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0604161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6675  hypothetical protein  30.32 
 
 
342 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2136  hypothetical protein  31.95 
 
 
342 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.298918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0778  hypothetical protein  21.46 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0625  hypothetical protein  22.55 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2119  hypothetical protein  28.31 
 
 
360 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>