81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1967 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2179  hypothetical protein  93.31 
 
 
359 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117736  hitchhiker  0.00445962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1967  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72287  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2471  hypothetical protein  62.6 
 
 
365 aa  418  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1530  hypothetical protein  65.8 
 
 
361 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.466314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1416  hypothetical protein  51.03 
 
 
354 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1033  hypothetical protein  51.55 
 
 
357 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0999  hypothetical protein  51.55 
 
 
357 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2119  hypothetical protein  51.45 
 
 
360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4271  hypothetical protein  43.49 
 
 
348 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.990265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3703  hypothetical protein  46.41 
 
 
364 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3942  hypothetical protein  45.39 
 
 
367 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32994  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1771  hypothetical protein  47.18 
 
 
369 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3020  hypothetical protein  48.93 
 
 
348 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3390  hypothetical protein  48.57 
 
 
348 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6675  hypothetical protein  48.48 
 
 
342 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3784  hypothetical protein  49.65 
 
 
336 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.398301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2411  hypothetical protein  39.19 
 
 
363 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2136  hypothetical protein  47.65 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.298918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3518  hypothetical protein  46.48 
 
 
355 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000767611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6217  hypothetical protein  51.95 
 
 
336 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1724  hypothetical protein  46.64 
 
 
344 aa  206  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1784  hypothetical protein  45.57 
 
 
340 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.385363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2120  hypothetical protein  45.25 
 
 
340 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7087  hypothetical protein  49.22 
 
 
337 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0500  hypothetical protein  39.56 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.150258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0638  hypothetical protein  40.6 
 
 
369 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205162  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2222  hypothetical protein  35.73 
 
 
351 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1936  hypothetical protein  41.53 
 
 
338 aa  175  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.394399  hitchhiker  0.0000381531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0569  hypothetical protein  38.83 
 
 
351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3464  hypothetical protein  44.44 
 
 
334 aa  166  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2387  hypothetical protein  39.26 
 
 
326 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0596  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3000  hypothetical protein  30.82 
 
 
358 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.974261  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0485  hypothetical protein  27.94 
 
 
341 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2303  hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000471514  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1967  hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.650951 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01310  hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00001579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1437  hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2324  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01299  hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002208  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1555  hypothetical protein  26.88 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1533  hypothetical protein  26.88 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1800  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.824337  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1421  membrane protein-like protein  26.34 
 
 
405 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.667551  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2326  hypothetical protein  35.2 
 
 
347 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2606  hypothetical protein  34.64 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1726  hypothetical protein  30.61 
 
 
352 aa  93.2  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2532  hypothetical protein  29.08 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1899  hypothetical protein  29.08 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.12937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1791  hypothetical protein  29.08 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2475  hypothetical protein  27.56 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1466  hypothetical protein  27.88 
 
 
353 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.484539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1809  hypothetical protein  27.56 
 
 
353 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.341639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1230  hypothetical protein  30.69 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1870  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1648  hypothetical protein  26.92 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2153  hypothetical protein  31.68 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1808  hypothetical protein  26.92 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000894217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01918  hypothetical protein  23.24 
 
 
346 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1506  hypothetical protein  27.71 
 
 
410 aa  86.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2618  hypothetical protein  28.37 
 
 
353 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.47564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3768  hypothetical protein  33.82 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.427736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2574  hypothetical protein  24.27 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.828972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003164  DUF697 domain-containing protein  24.34 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1644  hypothetical protein  26.48 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1621  hypothetical protein  27.31 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.570654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2733  hypothetical protein  26.48 
 
 
406 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.47044  normal  0.16271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1758  hypothetical protein  31.08 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1610  hypothetical protein  27.31 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2492  hypothetical protein  28.23 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0925  hypothetical protein  25.97 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3096  hypothetical protein  29.05 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.361386  hitchhiker  0.000029211 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00139  hypothetical protein  27.82 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1811  hypothetical protein  28.1 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1558  hypothetical protein  28.33 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947174  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2665  hypothetical protein  27.08 
 
 
370 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.781372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1241  hypothetical protein  27.57 
 
 
362 aa  53.1  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0326375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1174  hypothetical protein  31.09 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2644  hypothetical protein  26.75 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.582755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2478  hypothetical protein  26.51 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2546  hypothetical protein  26.75 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>