55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08920  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.235686  hitchhiker  0.0000000335802 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2083  protein of unknown function DUF552  53.41 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.009742  hitchhiker  0.00000000000013242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09430  Protein of unknown function (DUF552)  47.73 
 
 		 305 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00133111  normal  0.107393 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0492  protein of unknown function DUF552  37.8 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.042492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0457  cell division family protein  39.02 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0137  hypothetical protein  32.73 
 
 		 159 aa  53.5  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0371341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  35.21 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1600  protein of unknown function DUF552  28.12 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1079  protein of unknown function DUF552  34.85 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  33.72 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  29.07 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  27.06 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22750  hypothetical protein  31.09 
 
 		 165 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.515425  normal  0.0364691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2405  protein of unknown function DUF552  33.82 
 
 		 162 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.251598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3261  hypothetical protein  31.76 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  29.27 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3312  hypothetical protein  31.76 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3250  hypothetical protein  31.76 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1238  protein of unknown function DUF552  30.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1289  protein of unknown function DUF552  30.88 
 
 		 162 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3193  protein of unknown function DUF552  23.93 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.749912  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2921  protein of unknown function DUF552  26.74 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00244461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  29.21 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4046  protein of unknown function DUF552  28.79 
 
 		 149 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00125634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3318  protein of unknown function DUF552  29.23 
 
 		 152 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000684072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2994  hypothetical protein  29.41 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5696  hypothetical protein  29.35 
 
 		 124 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3517  hypothetical protein  29.41 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0721193  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12177  hypothetical protein  28.24 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.899747  normal  0.644491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3208  hypothetical protein  27.91 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1577  protein of unknown function DUF552  29.41 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3434  hypothetical protein  27.91 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447555  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27340  hypothetical protein  27.78 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1576  hypothetical protein  29.41 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13540  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1016  protein of unknown function DUF552  31.82 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1116  hypothetical protein  25.58 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1412  hypothetical protein  25.58 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10860  hypothetical protein  32.86 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0170593  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0754  ylmF protein  25.61 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1413  hypothetical protein  37.1 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000663721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4006  hypothetical protein  30.23 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0827549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1905  protein of unknown function DUF552  28.57 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3011  protein of unknown function DUF552  26.56 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1035  protein of unknown function DUF552  27.5 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000196256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2876  hypothetical protein  25.58 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17566  normal  0.55064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0903  protein of unknown function DUF552  25.58 
 
 		 172 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1421  hypothetical protein  25.61 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00683826  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6101  protein of unknown function DUF552  27.17 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608193  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5091  hypothetical protein  24.39 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153174  hitchhiker  0.00267894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1024  hypothetical protein  26.25 
 
 		 175 aa  42  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.695466  hitchhiker  0.00825865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16510  hypothetical protein  25.68 
 
 		 190 aa  42  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809047  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1142  cell division protein  24.24 
 
 		 180 aa  42  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3057  hypothetical protein  27.14 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  25.76 
 
 		 137 aa  41.6  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>