111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5757 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  100 
 
 
215 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27340  hypothetical protein  57.73 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2994  hypothetical protein  46.05 
 
 
224 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1024  hypothetical protein  70.48 
 
 
175 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.695466  hitchhiker  0.00825865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3057  hypothetical protein  70.41 
 
 
165 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1116  hypothetical protein  73.47 
 
 
210 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3517  hypothetical protein  47.71 
 
 
210 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0721193  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2876  hypothetical protein  66.97 
 
 
167 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17566  normal  0.55064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1421  hypothetical protein  64.06 
 
 
187 aa  151  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00683826  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2921  protein of unknown function DUF552  65.74 
 
 
177 aa  151  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00244461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1412  hypothetical protein  70.87 
 
 
175 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6101  protein of unknown function DUF552  75.28 
 
 
203 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608193  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5091  hypothetical protein  65.55 
 
 
192 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153174  hitchhiker  0.00267894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0903  protein of unknown function DUF552  72.63 
 
 
172 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10359  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  42.86 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3250  hypothetical protein  46.88 
 
 
220 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3312  hypothetical protein  46.88 
 
 
220 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3261  hypothetical protein  46.88 
 
 
220 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289859  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  79.07 
 
 
267 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4006  hypothetical protein  43.38 
 
 
193 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0827549  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3434  hypothetical protein  64.76 
 
 
226 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447555  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3208  hypothetical protein  41.25 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12177  hypothetical protein  42.92 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.899747  normal  0.644491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3011  protein of unknown function DUF552  41.47 
 
 
255 aa  138  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3193  protein of unknown function DUF552  51.16 
 
 
187 aa  134  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.749912  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22750  hypothetical protein  57.01 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.515425  normal  0.0364691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1600  protein of unknown function DUF552  62.14 
 
 
164 aa  124  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1289  protein of unknown function DUF552  65.93 
 
 
162 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1576  hypothetical protein  52.38 
 
 
178 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1577  protein of unknown function DUF552  57.89 
 
 
176 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10860  hypothetical protein  53.33 
 
 
162 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0170593  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2405  protein of unknown function DUF552  67.07 
 
 
162 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.251598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1079  protein of unknown function DUF552  54.81 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208009  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16510  hypothetical protein  57.14 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809047  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3796  protein of unknown function DUF552  38.61 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.423363  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13540  hypothetical protein  58.44 
 
 
210 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270166  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0457  cell division family protein  48.78 
 
 
152 aa  94  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  43.82 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0137  hypothetical protein  43 
 
 
159 aa  91.7  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0371341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  38.74 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8946  hypothetical protein  51.35 
 
 
130 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  41.38 
 
 
151 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3321  hypothetical protein  40.43 
 
 
126 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1016  protein of unknown function DUF552  37.65 
 
 
144 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1320  hypothetical protein  34.04 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  38.36 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0791  hypothetical protein  34.57 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000158069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3641  hypothetical protein  32.35 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000538076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3658  hypothetical protein  32.35 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.176518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4000  ylmF protein  32.35 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000660664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1241  ylmF protein  32.35 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000979962  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3913  ylmF protein  32.35 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000167056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3750  ylmF protein  32.35 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0779289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4038  hypothetical protein  32.35 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1413  hypothetical protein  42.47 
 
 
142 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000663721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4046  protein of unknown function DUF552  34.48 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00125634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2548  hypothetical protein  32.43 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.232838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0597  protein of unknown function DUF552  33.33 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000329372  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1238  protein of unknown function DUF552  31.37 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1905  protein of unknown function DUF552  35.29 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1035  protein of unknown function DUF552  39.19 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000196256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3944  ylmF protein  31.68 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1491  cell division protein  31.82 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3951  ylmF protein  31.68 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3726  hypothetical protein  31.82 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0030403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1200  cell division protein  36.36 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2060  cell division protein  30 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  34.62 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2492  hypothetical protein  42.65 
 
 
117 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0859  hypothetical protein  29.31 
 
 
146 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00767621  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0492  protein of unknown function DUF552  32.1 
 
 
226 aa  62  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.042492  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0713  hypothetical protein  27.59 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09230  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00237641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2107  hypothetical protein  30.68 
 
 
149 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000203247  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1821  hypothetical protein  30.68 
 
 
149 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000225081  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0594  hypothetical protein  32.18 
 
 
138 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1345  protein of unknown function DUF552  22.13 
 
 
145 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000191769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4422  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  59.3  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000112454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2059  hypothetical protein  31.33 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976966  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1142  cell division protein  27.08 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1248  hypothetical protein  28.05 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1273  hypothetical protein  28.05 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000107088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1471  protein of unknown function DUF552  28.75 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000569683  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0648  hypothetical protein  34.86 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0754  ylmF protein  28.38 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446928  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1730  hypothetical protein  32.58 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2024  hypothetical protein  34.86 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166297  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0954  hypothetical protein  21.59 
 
 
142 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000182129  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04571  hypothetical protein  36.49 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04471  hypothetical protein  32.58 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.811311  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4907  hypothetical protein  32.91 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0835083  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03921  hypothetical protein  35.44 
 
 
192 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1695  protein of unknown function DUF552  28.21 
 
 
190 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1714  protein of unknown function DUF552  28.21 
 
 
190 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00287605  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2900  hypothetical protein  31.71 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000121592  unclonable  0.000000137854 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04151  hypothetical protein  36.99 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0391  hypothetical protein  36.99 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04461  hypothetical protein  36.99 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0691442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2361  hypothetical protein  23.53 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000014385  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08920  hypothetical protein  25.71 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.235686  hitchhiker  0.0000000335802 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>