114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1486 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  42.93 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2921  protein of unknown function DUF552  40.98 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00244461  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1024  hypothetical protein  43.64 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.695466  hitchhiker  0.00825865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3057  hypothetical protein  33.52 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3193  protein of unknown function DUF552  33.33 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.749912  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4046  protein of unknown function DUF552  38.18 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00125634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0903  protein of unknown function DUF552  43.82 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2876  hypothetical protein  43 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17566  normal  0.55064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1116  hypothetical protein  43.82 
 
 		 210 aa  92  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1412  hypothetical protein  34.08 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3011  protein of unknown function DUF552  39.8 
 
 		 255 aa  91.3  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  42.7 
 
 		 215 aa  90.9  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4006  hypothetical protein  31.46 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0827549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  40.43 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1238  protein of unknown function DUF552  35.33 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3208  hypothetical protein  34.04 
 
 		 229 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1421  hypothetical protein  38.14 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00683826  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0954  hypothetical protein  34.51 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000182129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5091  hypothetical protein  39.58 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153174  hitchhiker  0.00267894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3434  hypothetical protein  31.69 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447555  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1016  protein of unknown function DUF552  40.4 
 
 		 144 aa  85.9  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6101  protein of unknown function DUF552  36.45 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608193  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12177  hypothetical protein  34.69 
 
 		 241 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.899747  normal  0.644491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1577  protein of unknown function DUF552  31.35 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22750  hypothetical protein  38.89 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.515425  normal  0.0364691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2994  hypothetical protein  38.2 
 
 		 224 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  37.78 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3517  hypothetical protein  38.2 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0721193  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1413  hypothetical protein  38.1 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000663721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09230  hypothetical protein  30.71 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00237641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  39.53 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3250  hypothetical protein  35 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3312  hypothetical protein  35 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3261  hypothetical protein  35 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0791  hypothetical protein  38.89 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000158069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27340  hypothetical protein  39.77 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1289  protein of unknown function DUF552  42.22 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2405  protein of unknown function DUF552  42.39 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.251598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1576  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1079  protein of unknown function DUF552  36.36 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1600  protein of unknown function DUF552  39.13 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10860  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0170593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0597  protein of unknown function DUF552  35.63 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000329372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0713  hypothetical protein  35.56 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1905  protein of unknown function DUF552  37.76 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1035  protein of unknown function DUF552  37.5 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000196256  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13540  hypothetical protein  41.56 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3321  hypothetical protein  37.35 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1320  hypothetical protein  34.94 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4000  ylmF protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000660664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1241  ylmF protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000979962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16510  hypothetical protein  39.44 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809047  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0492  protein of unknown function DUF552  36.25 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.042492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3944  ylmF protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3750  ylmF protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0779289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3641  hypothetical protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000538076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3658  hypothetical protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.176518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4038  hypothetical protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2548  hypothetical protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.232838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3951  ylmF protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3913  ylmF protein  35.06 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000167056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8946  hypothetical protein  38.16 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3726  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0030403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0549  protein of unknown function DUF552  28.32 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0457  cell division family protein  37.04 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1248  hypothetical protein  37.18 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1273  hypothetical protein  37.18 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000107088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0754  ylmF protein  37.18 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0137  hypothetical protein  37.35 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0371341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1695  protein of unknown function DUF552  28.76 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1714  protein of unknown function DUF552  28.76 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00287605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3796  protein of unknown function DUF552  36 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.423363  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2361  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000014385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5696  hypothetical protein  32.38 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1471  protein of unknown function DUF552  38.67 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000569683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1730  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0859  hypothetical protein  32.95 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00767621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4422  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000112454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  26.51 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2900  hypothetical protein  38.96 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000121592  unclonable  0.000000137854 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04471  hypothetical protein  34.69 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.811311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3318  protein of unknown function DUF552  26.97 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000684072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2107  hypothetical protein  30.68 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000203247  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1821  hypothetical protein  30.68 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000225081  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04571  hypothetical protein  39.47 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1345  protein of unknown function DUF552  25.25 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000191769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1200  cell division protein  36.23 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04151  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0391  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04461  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0691442  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2059  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4907  hypothetical protein  29.31 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0835083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21471  hypothetical protein  39.73 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2024  hypothetical protein  39.73 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03921  hypothetical protein  38.36 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0594  hypothetical protein  29.33 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195332  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0648  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802992  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0919  protein of unknown function DUF552  31.87 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00430276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>