111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1821 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2107  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000203247  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1821  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000225081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0597  protein of unknown function DUF552  41.29 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000329372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  37.67 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0713  hypothetical protein  36.17 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0791  hypothetical protein  37.07 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000158069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  35.51 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4046  protein of unknown function DUF552  38.32 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00125634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1413  hypothetical protein  33.79 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000663721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1016  protein of unknown function DUF552  39.81 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0859  hypothetical protein  35.51 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00767621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1345  protein of unknown function DUF552  33.57 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000191769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09230  hypothetical protein  37.27 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00237641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1200  cell division protein  32.09 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1905  protein of unknown function DUF552  32.2 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0954  hypothetical protein  34.69 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000182129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0594  hypothetical protein  28.99 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2876  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17566  normal  0.55064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1035  protein of unknown function DUF552  34.02 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000196256  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1248  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1273  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000107088  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0919  protein of unknown function DUF552  32.99 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00430276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0754  ylmF protein  32.94 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0903  protein of unknown function DUF552  33.68 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2921  protein of unknown function DUF552  27.35 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00244461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3944  ylmF protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.811311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3951  ylmF protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3321  hypothetical protein  30.47 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3750  ylmF protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0779289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3641  hypothetical protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000538076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3658  hypothetical protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.176518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1116  hypothetical protein  34.41 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4038  hypothetical protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2361  hypothetical protein  34.83 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000014385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4000  ylmF protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000660664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1241  ylmF protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000979962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3913  ylmF protein  29.82 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000167056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3726  hypothetical protein  30.43 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0030403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  30.95 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  36.36 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22750  hypothetical protein  32.23 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.515425  normal  0.0364691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27340  hypothetical protein  32.95 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1421  hypothetical protein  28.71 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00683826  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03921  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2548  hypothetical protein  29.2 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.232838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1695  protein of unknown function DUF552  27.33 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6101  protein of unknown function DUF552  32.22 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608193  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1714  protein of unknown function DUF552  27.33 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00287605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1238  protein of unknown function DUF552  31.78 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1471  protein of unknown function DUF552  35.06 
 
 		 210 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000569683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1491  cell division protein  30.68 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4422  hypothetical protein  25.77 
 
 		 197 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000112454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0549  protein of unknown function DUF552  26.71 
 
 		 195 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0457  cell division family protein  25 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1024  hypothetical protein  32.98 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.695466  hitchhiker  0.00825865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21471  hypothetical protein  34.44 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1320  hypothetical protein  26.9 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197076  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0648  hypothetical protein  35.56 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802992  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04571  hypothetical protein  32.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5091  hypothetical protein  27.72 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153174  hitchhiker  0.00267894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2900  hypothetical protein  32.22 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000121592  unclonable  0.000000137854 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0391  hypothetical protein  22.97 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3208  hypothetical protein  31.82 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3434  hypothetical protein  31.82 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447555  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  30.34 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  30.68 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04461  hypothetical protein  24.16 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0691442  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2024  hypothetical protein  34.52 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3517  hypothetical protein  23.24 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0721193  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2994  hypothetical protein  28.89 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342705 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04151  hypothetical protein  28.72 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3057  hypothetical protein  24.7 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  30.23 
 
 		 267 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1577  protein of unknown function DUF552  30.71 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4907  hypothetical protein  32.94 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0835083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12177  hypothetical protein  28.89 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.899747  normal  0.644491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4006  hypothetical protein  28.41 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0827549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2059  hypothetical protein  23.49 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3193  protein of unknown function DUF552  28.89 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.749912  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3250  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3312  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3261  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1289  protein of unknown function DUF552  28.57 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3011  protein of unknown function DUF552  28.89 
 
 		 255 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1079  protein of unknown function DUF552  33.78 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1600  protein of unknown function DUF552  32.05 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1890  protein of unknown function DUF552  32.1 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000364374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3318  protein of unknown function DUF552  29.03 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000684072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2405  protein of unknown function DUF552  30.26 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.251598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  24.72 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13351  hypothetical protein  32.88 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.703237 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10860  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  50.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0170593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8946  hypothetical protein  27.91 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13540  hypothetical protein  30.34 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270166  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0137  hypothetical protein  31.58 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0371341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>